La contraparte política con la que trabaja AmPaz es la Agencia Presidencial de Cooperación Internacional de Colombia (APC).
Como contrapartes ejecutoras se encuentran:
- La Consejería Presidencial para la Estabilización y Consolidación
- Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible -MADS-
- Agencia Nacional de Renovación del Territorio -ART-
En las regiones de Meta y Caquetá, el proyecto se implementa con apoyo de entidades gubernamentales del orden departamental y municipal, autoridades ambientales regionales, otras instituciones socias y actores clave, quienes participan activamente en el desarrollo del proyecto a través de un comité de conducción.